故事讲述一之濑麻衣在修学旅行时结识了一叶，决定成为舞姬。她说服了反对的父母，并于初中毕业后来到京都。但是，事先约好的舞姬馆却突然关门了。走投无路的麻衣很偶然地与一叶重逢。一叶把麻衣介绍给了自己所在的舞姬馆“菊屋”的老板娘…

世界的人口因为不明原因而急降，逐渐步出历史的舞台，取而代之的是一种平均身高只有10公分、三头身的妖精。这些妖精拥有高智能，而本作的女主角则成为了人类与妖精之间的调停官，负责斡旋在妖精与人类之间的重要事务。