立志成为第一流的神奇宝贝大师，小智他们依然继续踏上旅程。这天，当小智与训练家的战斗结束之后，他们收到一封由快龙送来的神秘招待券。招待券里面写着:'你们是最被看好，最有前途的神奇宝贝训练家，我以最强的神奇宝贝训练家的身份，邀…

小智和同伴们遇到了街头表演明星少女广美。广美是“水之民”的末裔，她能和水中的口袋怪兽交流。小智他们从广美那里听说，大海里有一座由水之民建造的“海之神殿”，里面藏着稀世珍宝“海之王冠”。这时，传说中的口袋怪兽援助员杰克突然…

为了参加下一场神奇宝贝华丽大赛，小智、小光和小刚一行人来到了阿拉莫斯镇。他们在镇上遇见了一个名叫爱丽斯的漂亮女孩。爱丽斯带着大家四处游览，并参观这里的标志性建筑——时空之塔和一座美丽庭园。在这座庭园里，小智发现了可疑的影…

“反转世界”是存在于这个世界内部的镜子般不可思议的世界。那个美丽而规则的世界，是骑拉帝纳栖居的特殊空间。然而帝牙卢卡和帕路奇犽的战斗造成了时空的扭曲，“反转世界”也因此完全被阴霾笼罩。由于自己的世界被污染而被激怒的骑拉帝…

王冠市是个水与绿茵、古街道与近代建筑完美调合的城市。为了观看正在这里举办的“神奇宝贝足篮世界杯”，小智一行人向王冠市前进。在旅途中，小智们与正在寻找同伴的神奇宝贝索罗亚相遇，并一起结伴同行。 就在此时，被称为索罗亚克的神…

在电影开始开篇，场景被设置在40年前的一片大森林中。 一个叫小羽的男孩想进去那个森林去画画，在森林内，小羽遇到了被神奇宝贝猎人追捕并受重伤的雪拉比，当他们被神奇宝贝猎人追的走投无路的时候，雪拉比带着小羽到了40年后，正好小智…

小智和同伴们遇到了街头表演明星少女广美。广美是“水之民”的末裔，她能和水中的口袋怪兽交流。小智他们从广美那里听说，大海里有一座由水之民建造的“海之神殿”，里面藏着稀世珍宝“海之王冠”。这时，传说中的口袋怪兽援助员杰克突然…

在很远很远的地方，有一片巨木森林，里面住着三只可爱的兔宝宝:憨憨，肥肥和美美。它们的母亲去远方之前，留下了三件神奇的宝贝--智慧书包，毅力跑鞋和勇气宝盒。森林里的快狼帅呆呆和超狼花秀秀对这三件宝贝垂涎不已。为了夺取三件宝贝…