日暮篱是个普通的国三学生，同时是神社的女儿。她在十五岁生日的那天突然闯入了时光隧道，回到了五百年前的日本战国时代，并与被封印于神木的半妖「犬夜叉」相遇。当时犬夜叉正打算靠「四魂之玉」的力量，让自己成为真正的妖怪。但是什么…

50年只出现一次的传说之岛“蓬莱岛”。曾经，犬夜叉想和桔梗一起从统治蓬莱岛的四斗神手中救下岛上仅存的蓝等半妖小孩，但在仅差一步的关头，岛就突然消失了……50年后——这座蓬莱岛再次在这个世界出现。犬夜叉他们到达蓬莱岛，为了解开…