立志成为第一流的神奇宝贝大师，小智他们依然继续踏上旅程。这天，当小智与训练家的战斗结束之后，他们收到一封由快龙送来的神秘招待券。招待券里面写着：‘你们是最被看好、最有前途的神奇宝贝训练家，我以最强的神奇宝贝训练家的…

立志成为第一流的神奇宝贝大师，小智他们依然继续踏上旅程。这天，当小智与训练家的战斗结束之后，他们收到一封由快龙送来的神秘招待券。招待券里面写着：‘你们是最被看好、最有前途的神奇宝贝训练家，我以最强的神奇宝贝训练家的身份，…

故事以大都市纽特市为舞台，在那里正在兴建为保护神奇宝贝而设立的设施神奇宝贝山庄，即将在近期完工。但是因失去了过去的故乡，而将所见的一切都视作敌人攻击的盖诺赛克特也出现在这里！只见他朝着在现场的小智和皮卡丘发射破坏技术，千…

一群疯狂的科学家，为了自己的梦想，研制出一套只需要少许基因便可复制出宠物小精灵的机器，并把发掘到的世界最强宠物小精灵复制成了拥有比梦幻更强能力的超梦。但当超梦醒来后，却因无法找寻到真正的自我而暴走。火箭队的老大出现在超梦…