马柯是一位在海外工作的中国员工，一次意外事故让他发现公司正在推广销售的新型技术背后存在着巨大安全隐患。为了寻找真相，马柯开始调查公司背后的层层黑幕。

上一部结尾，尼奥（基奴李维斯 饰）终于意识到自己的能力和使命，中弹复活后，变成了无所不能的“救世主”，他和女友崔妮蒂（凯莉·安·摩丝 饰），舰长墨菲斯（劳伦斯·菲什伯恩 饰）回到了人类的基地锡安，受到人们的热烈欢迎。此时，…