黑田藩藩主齐隆侯将宠爱的妃子生的女儿滨千代公主假扮男孩，秘密继承储君之位。菩提寺住持慈善和黑锹忍者得知此事，写作秘函送往江户。拜一刀（若山富三郎饰）受黑田藩所托，追赶主持抢夺秘函。途中拜一刀遭遇黑田藩忍者不知火（安田道代…

刚毕业的医学院学生保本（加山雄三 Yuzo Kayama 饰），在父亲的介绍下，来到穷乡僻壤的小石川诊所实习。他的老师是一位被称作红胡子（三船敏郎 Toshiro Mifune 饰）的古怪医师。起初，向往长崎的保本对这个贫民窟厌恶之极，并迁怒于红胡…