故事舞台在21世纪中期的东京，那时东京已经因为温暖化而被密林所覆盖，被骤雨与恐怖的热带蚊所威胁的人们建起了以希腊巨神阿特拉斯命名的高塔移迁到了空中。但是并不是所有的人类都拥有这样的福利，贫困的人们仍然得留在地面与种种危机为…

<p>日暮戈薇是就读于国中三年级的15岁普通小女生，某日，她偶然通过家中神社的枯井来到了500年前的战国时代。时狼烟四起，妖怪横行，世间大地生灵涂炭。戈薇在御神木那里邂逅了被封印的半妖犬夜叉。50年前，意欲变成真正妖怪的犬夜…

原因不明的地震频仍、随着地球温室效应而上升的水位…… 　　此时，它突然出现在人类的眼前…… 　　人们叫它“欧凡（Orphan）”并期待新时代的到来…… 　　又在同时，叫做“有机圆盘”的物体出现在提求上。这些圆盘一旦出现在地表上，…

这是一个人类科技高度发达，已可以自由出入宇宙的时代…… 　　人们纷纷向太空的殖民卫星移民并形成庞大的群体，随后便为争取政治、经济地位而掀起运动，进而引发了地球与殖民卫星的武力冲突。战火不断地燃烧，数以千万计人们的生命被一…

某个时代，战争随处可见，大量的巨大舰艇和机器武士在天空中混战。 　　没有胜利者的欢呼，只有失败武士落寞的身影和失去土地的农民的哀号。 　　逃离战场的部分流浪武士变成了山贼，他们到处抢夺农民的粮食与女人。由于惧怕山贼，农民们…

冬树和KERORO小队一同去印加帝国的遗迹马丘比丘观光。冬树一向喜欢神秘事物，到了那里非常兴奋，而KERORO则依然满脑子想着如何侵略地球。他们在那里发现了一个未被开发的古代迷宫，但因为中了陷阱不得不仓皇离开，没能尽兴地探查一番。就…