这一季也是《迷失》的最后一季。第六季同样是跟随两个时间线，两条时间线在第五季结尾核弹爆炸后出现。第一条时间线，称为“闪边世界”，海洋航空815航班没有坠毁于小岛上。第二条时间线，是原来的时间线，在核弹爆炸后，生存者们时空转…

第五季跟随着两条时间线: 第一条时间线是发生于小岛上，没有离开小岛的生还者经历着不规则的时空转移，最后他们被困于1974年的时空中；第二条时间线延续了原来的时间线，描述离岛生还者在小岛外的故事，以及他们于2007年搭乘Ajira航…

讲述了城堡石镇上的黑人男孩亨利小时候曾在雪天失踪12天，其养父为了找寻他而受伤身亡，随后亨利突然出现，却完全遗忘这12天里发生的事情。镇上的人纷纷怀疑是亨利把养父推下悬崖，指责亨利是不详的凶手。长大后，亨利离开了城堡石，成为…