《饼干警长》的故事发生在一个神奇的食品王国--"饼干城"里。饼干城的一切都是由食品构成的，蛋糕皇宫，糖果靴警局，爆米花电影院，牛奶河。。。居住在这个美丽小镇的是天性善良，长相可爱的饼干人。饼干城的最高统治者是集成了…

故事讲述了在一个神奇的食品王国里，居住着各种各样的饼干人，他们单纯而善良。不按常理出牌的饼干警长，慢性子助手曲奇警员是王国的守护者，他们与妄图夺取王国统治权的霉脸大盗一伙斗争到底，在饼干城里展开了一系列有趣的警匪故事。