故事讲述女主角哀川巧克丽，是一位巧克力职人，她独自开了一间魔法巧克力专门店「巧克力·暗黑」。「巧克力·暗黑」除了是一间卖巧克力的地方，这里还有一个秘密——若前来光顾的人为了生活、人际关系、恋爱或…

　故事的女主角是与身为兽医的母亲相依为命的少女艾琳。有一天，被母亲照料的用于战斗的一头大公的斗蛇一夜之间死亡，这被认为是照顾者的责任，导致她母亲遭到了活活地被斗蛇吞食的残暴刑法。

高中二年级的冬天，男主角戎崎裕一住院了。在医院，他遇见了同年的里香。里香虽是美人，却非常任性。裕一无聊的住院生活因为里香的折腾而改变着。有一天，裕一知道了里香隐藏在任性中的真相... 断定自己会死去的少女里香与裕一的医院青春…

故事发生在遥远的未来，人类同一种通过契约追随在旁的最强武器种族——艾迪莱特生活在一起，关于这个种族他们的诞生和文化等等一切全都是个谜。空盗团“红山猫”的少年库多·杰尔埃特，因为一个偶然的机会，遇到了被封印在古老的箱子中的…

江户时代末期（本作的20年前），被称为天人（あまんと）的谜之异星人来袭。于是地球人与天人之间的战争瞬即爆发，为数众多的武士和攘夷派志士都参与与天人的战斗。幕府见识到天人强大的实力后，最终向天人低头，放弃武士不管，擅自与天人…